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- Aecidium hornotinum
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- Aecidium jalapense
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- Aecidium jalapense
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- Aecidium leonense
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- Aecidium ligustricola
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- Aecidium macowanianum f. conyzae-pinnatilobatae
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- MICH13167
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- Aecidium minimum
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- MICH13169
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- Aecidium minoense
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- Aecidium minutulum
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- Aecidium mirabilis
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- Aecidium muehlenbeckiae
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- Aecidium ocfemianum
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- Aecidium pelargonii
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- Aecidium pereskiae
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- Aecidium pereziae
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- Aecidium phlomidis
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- Aecidium poasense
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- Aecidium poecilochromae
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- MICH13188
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- Aithaloderma longisetum
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- MICH13767
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- Albugo ipomoeae-pes-caprae
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- MICH10268
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- Aleuria michiganensis
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- MICH13768
- Basionym
- Allosoma cestri
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- MICH13769
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- Alternaria asphodeli
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- MICH15176
- Basionym
- Amanita malheurensis
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- MICH429
- Basionym
- Amerodothis guianensis
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- MICH13770
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- Amphisphaeria dothideaspora
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- MICH13771
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- Anisochora tabebiuae
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- MICH13772
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- Anomothallus erraticus
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- Antennellina hawaiiensis
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- MICH13774
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- Antennularia liabi
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- MICH13775
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- Anthostoma junglandinum caryae
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- MICH13776
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- Anthostoma microecium
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- MICH13777
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- Anthostoma patagonicum
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- MICH13778
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- Anthostomella minor
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- MICH13779
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- Anthostomella ratibidae
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- MICH13780
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- Anthostomella rhizophorae
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- MICH13781
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- Antimanoa grisleae
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- MICH13782
- Basionym
- Apiosporium rehmii
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- MICH13783
- Basionym
- Aporia hyperici
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- MICH13784
- Basionym
- Aposphaeria alpigena
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- MICH15177