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- Aecidium muehlenbeckiae
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- Aecidium ocfemianum
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- Aecidium phlomidis
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- Aecidium poasense
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- Aecidium poecilochromae
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- MICH13188
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- Aithaloderma longisetum
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- MICH13767
- Basionym
- Albugo ipomoeae-pes-caprae
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- MICH10268
- Basionym
- Aleuria michiganensis
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- MICH13768
- Basionym
- Allosoma cestri
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- MICH13769
- Basionym
- Alternaria asphodeli
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- MICH15176
- Basionym
- Amanita malheurensis
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- MICH429
- Basionym
- Amerodothis guianensis
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- MICH13770
- Basionym
- Amphisphaeria dothideaspora
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- MICH13771
- Basionym
- Anisochora tabebiuae
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- MICH13772
- Basionym
- Anomothallus erraticus
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- MICH13773
- Basionym
- Antennellina hawaiiensis
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- MICH13774
- Basionym
- Antennularia liabi
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- MICH13775
- Basionym
- Anthostoma junglandinum caryae
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- MICH13776
- Basionym
- Anthostoma microecium
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- MICH13777
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- Anthostoma patagonicum
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- MICH13778
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- Anthostomella minor
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- MICH13779
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- Anthostomella ratibidae
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- MICH13780
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- Anthostomella rhizophorae
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- MICH13781
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- Antimanoa grisleae
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- MICH13782
- Basionym
- Apiosporium rehmii
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- MICH13783
- Basionym
- Aporia hyperici
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- MICH13784
- Basionym
- Aposphaeria alpigena
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- MICH15177
- Basionym
- Aposphaeria major
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- MICH15178
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- Aposphaeria pezizoides
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- MICH15179
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- Aposphaeria salicum
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- MICH15180
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- Arachnopeziza delicatula
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- MICH13785
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- Arthrosporium compositum
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- MICH15181
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- Aschersonia aleyrodis
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- Aschersonia aleyrodis
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- Aschersonia aurantiaca
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- Aschersonia badia
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- Aschersonia caapi
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- MICH15187
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- Aschersonia disciformis
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- MICH15188
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- Aschersonia goldiana
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- Aschersonia incrassata
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- MICH15190
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- Aschersonia marginata
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- MICH15191
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- Ascobolus castaneus
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- MICH13786
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- Ascobolus notata
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- MICH13787
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- Ascochyta alismatis
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- MICH15192
- Basionym
- Ascochyta bacteriiformis
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- MICH15193
- Basionym
- Ascochyta caulicola
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- MICH15194
- Basionym
- Ascochyta chaerophylli
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- MICH15195